据韩联社报道，6月11日韩国国土基建交通部（MLIT）宣布，因飞行员违反安全条例，韩亚航空将面临2000万韩元（19675美元）的罚金和塞班航线停飞7天的处罚。该飞行员将被停飞30天。
4月19日韩亚航空飞往塞班的航班上，飞机引擎发出故障警告后，飞行员仍然起飞。MLIT表示因违反安全条例导致航班被停飞，韩亚此次是第一例。考虑到机票预售情况，具体航班停飞时期仍待协商。
自4月轮渡沉没事件之后，安全成韩国首要关注问题。一名未表明身份的韩亚官员称：“这种事情史无前例也令人震惊，MLIT此次采取强硬措施，我们肯定不会提出抗议。”