反服貿學運中要角林飛帆在3月18日佔領立法院時高喊「我們代表人民奪回立院」，提出主張 《兩岸服務貿易協議》應「先立法、再審查」 並一再挑戰馬政府，成為最敢衝的學運領。不過，根據youtube上的影片林飛帆挑明表示：「我主張台灣獨立。」將對「反服貿學運」帶來新一波衝擊。
林飛帆「我主張台灣獨立」影片立即引發網友正反意見。反對者表示「反服貿是假議題基本上是台獨本質」、「意圖十分明顯~~現在又要我們全民買單~他們該承擔的罪過?!」、「我會選擇移民美國，不會加入台灣、中國其中一方的戰爭。」、「就是有這種垃圾~~才搞得台灣這麼動盪不安~~」；也有人表示「主張台灣獨立沒有什麼不對的，就像主張兩岸統一」。
高齡97歲的台獨領袖史明已在27日進入議場聲援學生更令人聯想與林飛帆採激進方式佔領立法院不無關係。史明當時表示，這次抗爭行動代表著台灣人要「出頭天、做主人」，要求「堅持下去」。最後，史明獻唱「台灣獨立軍進行曲」，學生鼓掌表示支持。